我的工作出R.各R代码包含在一个特定的文件夹一些教程。 有在那里的数据文件和其他文件。 我想打开.r
文件和源是这样的,我没有改变Rstudio工作目录,如下图所示:
有没有在R.自动指定我的工作目录的方式
我的工作出R.各R代码包含在一个特定的文件夹一些教程。 有在那里的数据文件和其他文件。 我想打开.r
文件和源是这样的,我没有改变Rstudio工作目录,如下图所示:
有没有在R.自动指定我的工作目录的方式
我知道这个问题已经过时,但是我正在寻找的是一个解决方案,以及与谷歌在列出了最顶端:
this.dir <- dirname(parent.frame(2)$ofile)
setwd(this.dir)
把那个地方到文件(最好是开始,虽然),从而使WD根据该文件改变。
根据该意见,这可能不一定每一个平台上工作(的Windows似乎工作,Linux的/ Mac的一些)。 请记住,这个解决方案是“外包”的文件,并不一定是在该文件中运行块。
又见得到`source`d文件的文件名和路径
要获得来源正在脚本的位置,你可以使用utils::getSrcDirectory
或utils::getSrcFilename
。 因此,改变工作目录到当前文件的功能也可以用:
setwd(getSrcDirectory()[1])
如果你运行 ,而不是源荷兰国际集团它的代码,这并不在RStudio工作。 对于这一点,你需要使用rstudioapi::getActiveDocumentContext
。
setwd(dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path))
这第二个解决方案需要您使用RStudio作为IDE,当然。
这个答案可以帮助:
script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)
注:脚本必须以返回正确路径来源
我发现它在: https://support.rstudio.com/hc/communities/public/questions/200895567-can-user-obtain-the-path-of-current-Project-s-directory-
该BumbleBee's答案(与parent.frame代替sys.frame)didn't工作对我来说,我总是得到一个错误。
dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)
对我的作品,但如果你不想使用rstudioapi,你是不是在proyect,您可以使用符号〜在你的路径。 符号〜指的是默认RStudio(至少在Windows上)的工作目录。
如果您RStudio工作目录为“d:/文档”, setwd("~/proyect1")
是一样的setwd( “d:/文档/ proyect1”)。
一旦你设置,您可以导航到一个子目录: read.csv("DATA/mydata.csv")
相同read.csv("D:/Documents/proyect1/DATA/mydata.csv")
如果要导航到父文件夹,您可以使用"../"
。 例如: read.csv("../olddata/DATA/mydata.csv")
其是相同的read.csv("D:/Documents/oldata/DATA/mydata.csv")
这是我能写脚本,不管你用的是什么电脑最好的办法。
解决方案
dirname(parent.frame(2)$ofile)
不是为我工作。
我使用的是蛮力算法,但工程:
File <- "filename"
Files <- list.files(path=file.path("~"),recursive=T,include.dirs=T)
Path.file <- names(unlist(sapply(Files,grep,pattern=File))[1])
Dir.wd <- dirname(Path.file)
更容易搜索目录时:
Dirname <- "subdir_name"
Dirs <- list.dirs(path=file.path("~"),recursive=T)
dir_wd <- names(unlist(sapply(Dirs,grep,pattern=Dirname))[1])
对于rstudio ,您可以使用自动设置您的工作目录的脚本目录rstudioapi这样的:
library(rstudioapi)
# Getting the path of your current open file
current_path = rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
setwd(dirname(current_path ))
print( getwd() )
运行或Sourceing您的文件时,它的工作原理。
您需要首先安装包rstudioapi。 请注意我打印路径,以确保我在正确的地方100%,但这是可选的。
我只是在寻找一个解决这个问题,来到了这个页面。 我知道它的过时,但以前的解决方案,其中不满意或对我没有工作。 这是我的工作,周围如果有兴趣。
filename = "your_file.R"
filepath = file.choose() # browse and select your_file.R in the window
dir = substr(filepath, 1, nchar(filepath)-nchar(filename))
setwd(dir)
我明白这是过时的,但我不能得到前者的答案很满意地工作,所以我想贡献我的方法情况下,任何其他人遇到的意见,大黄蜂的回答中提到了同样的错误。
煤矿是基于一个简单的系统命令。 所有你喂的功能就是脚本的名称:
extractRootDir <- function(x) {
abs <- suppressWarnings(system(paste("find ./ -name",x), wait=T, intern=T, ignore.stderr=T))[1];
path <- paste("~",substr(abs, 3, length(strsplit(abs,"")[[1]])),sep="");
ret <- gsub(x, "", path);
return(ret);
}
setwd(extractRootDir("myScript.R"));
从功能的输出会看起来像"/Users/you/Path/To/Script"
。 希望这可以帮助别人谁可能得到坚持。
如果你在Linux上工作,你可以试试这个:
setwd(system("pwd", intern = T) )
这个对我有用。
我知道这是一个古老的线程,但我也有类似的问题,需要设置工作目录,并不能得到任何的解决方案,为我工作。 下面是没有工作,在跨越这种情况下,任何人绊倒以后:
# SET WORKING DIRECTORY TO CURRENT DIRECTORY:
system("pwd=`pwd`; $pwd 2> dummyfile.txt")
dir <- fread("dummyfile.txt")
n<- colnames(dir)[2]
n2 <- substr(n, 1, nchar(n)-1)
setwd(n2)
这是一个有点令人费解,但基本上这个使用系统命令来获取工作目录,并将其保存到dummyfile.txt,则R读取使用data.table :: FREAD该文件。 剩下的只是清理什么得到了打印到文件,这样我只剩下的目录路径。
我需要在集群上运行R,所以没有办法知道我在想到底是什么一目录(作业都会分配一个号码和一个计算节点)。 这奏效了我。
大多数的GUI假设,如果你在一个目录中,“打开”,双击,或以其他方式试图执行一个.R文件,在其驻留将是工作目录,除非另有规定的目录中。 Mac的图形用户界面提供了更改默认行为,这是您在运行的会话中设置的首的启动面板多变,并成为下一个“启动”有效的方法。 你应该也看:
?Startup
该RStudio文档说:
“当通过文件关联启动,RStudio自动设置工作目录打开文件的目录。” 默认设置是RStudio被注册为.R文件处理,虽然也有提及设置一个默认的“关联”与RStudio为.Rdata和.R的扩展能力。 是否有“处理”状态和“协会”的地位是在Linux上一样,我不能告诉。
http://www.rstudio.com/ide/docs/using/workspaces
dirname(parent.frame(2)$ofile)
不为我工作,要么,但以下(如建议https://stackoverflow.com/a/35842176/992088 )在Ubuntu 14.04为我工作
dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)
如果您在使用UTF-8编码:
path <- rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
Encoding(path) <- "UTF-8"
setwd(dirname(path))
您需要安装包rstudioapi如果你还没有这么做过。