这个问题建立在问题,我在这里问: 对数据的选择范围创建数据分区被送入插入符号::火车功能交叉验证 )。
我有看起来像这样的工作数据:
df <- data.frame(Effect = rep(seq(from = 0.05, to = 1, by = 0.05), each = 5), Time = rep(c(1:20,1:20), each = 5), Replicate = c(1:5))
基本上就是我想要做的就是创建自定义分区,如由生成的caret::groupKFold
功能,但这些褶皱是在指定的范围(即> 15天)和每个折叠与保持一个点是测试集,并与所有其他数据被用于训练。 这将在每次迭代被重复直到在指定的范围中的每个点被用作测试集。 @Missuse写了一些代码为此目的它获取接近期望输出用于上述链路这个问题。
我会尝试,并显示你所期望的输出,但在所有诚实插入符号:: groupKFold功能输出混淆了我,所以希望上面的描述就足够了。 乐于尝试,虽然澄清!
这里有一种方法,你可以创建一个使用所需的分区tidyverse
:
library(tidyverse)
df %>%
mutate(id = row_number()) %>% #create a column called id which will hold the row numbers
filter(Time > 15) %>% #subset data frame according to your description
split(.$id) %>% #split the data frame into lists by id (row number)
map(~ .x %>% select(id) %>% #clean up so it works with indexOut argument in trainControl
unlist %>%
unname) -> folds_cv
编辑:看来indexOut
预期参数不执行,但index
进行论证后这样做folds_cv
一个使用可以只获得倒数setdiff
:
folds_cv <- lapply(folds_cv, function(x) setdiff(1:nrow(df), x))
现在:
test_control <- trainControl(index = folds_cv,
savePredictions = "final")
quad.lm2 <- train(Time ~ Effect,
data = df,
method = "lm",
trControl = test_control)
一个警告:
Warning message:
In nominalTrainWorkflow(x = x, y = y, wts = weights, info = trainInfo, :
There were missing values in resampled performance measures.
> quad.lm2
Linear Regression
200 samples
1 predictor
No pre-processing
Resampling: Bootstrapped (50 reps)
Summary of sample sizes: 199, 199, 199, 199, 199, 199, ...
Resampling results:
RMSE Rsquared MAE
3.552714e-16 NaN 3.552714e-16
Tuning parameter 'intercept' was held constant at a value of TRUE
所以每个重新采样使用199行和预测1,重复一个我们希望在一个时间保持了所有50行。 这可以被验证了:
quad.lm2$pred
为什么Rsquared
缺少我不知道我会挖一个深一点。
文章来源: Specifiying a selected range of data to be used in leave-one-out (jack-knife) cross-validation for use in the caret::train function