作为延续到我以前的问题,我已经修改了内核的可变数量的代码。 然而,Gatherv在我的代码实现的方式似乎是不可靠的。 一旦在运行3-4在收集缓冲器的结束序列最终被损坏,它似乎是,由于存储器泄漏。 示例代码:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <mpi.h>
int main (int argc, char *argv[]) {
MPI_Init(&argc, &argv);
int world_size,*sendarray;
int rank, *rbuf=NULL, count,total_counts=0;
int *displs=NULL,i,*rcounts=NULL;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
if(rank==0){
displs = malloc((world_size+1)*sizeof(int));
for(int i=1;i<=world_size; i++)displs[i]=0;
rcounts=malloc(world_size*sizeof(int));
sendarray=malloc(1*sizeof(int));
for(int i=0;i<1;i++)sendarray[i]=1111;
count=1;
}
if(rank!=0){
int size=rank*2;
sendarray=malloc(size*sizeof(int));
for(int i=0;i<size;i++)sendarray[i]=rank;
count=size;
}
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
MPI_Gather(&count,1,MPI_INT,rcounts,1,MPI_INT,0,MPI_COMM_WORLD);
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
if(rank==0){
displs[0]=0;
for(int i=1;i<=world_size; i++){
for(int j=0; j<i; j++)displs[i]+=rcounts[j];
}
total_counts=0;
for(int i=0;i<world_size;i++)total_counts+=rcounts[i];
rbuf = malloc(10*sizeof(int));
}
MPI_Gatherv(sendarray, count, MPI_INT, rbuf, rcounts,
displs, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD);
if(rank==0){
int SIZE=total_counts;
for(int i=0;i<SIZE;i++)printf("(%d) %d ",i, rbuf[i]);
free(rbuf);
free(displs);
free(rcounts);
}
if(rank!=0)free(sendarray);
MPI_Finalize();
}
为什么会出现这种情况,是有办法解决它?
这一点在我的实际项目更糟。 每个发送缓冲器包含150个双打。 接收缓冲区变得非常脏,有的时候我床上终止的错误,退出代码为1,6或11。
任何人都可以至少重现我的错误?
我的猜测:我分别在每个线程上分配的内存sendarray。 如果我的虚拟机是1对1的硬件,那么,也许就不会有这样的问题。 但我只有2个内核,运行过程4个或更多。 难道是这个原因?