如何从GLM R中删除相关的变量(How to remove correlated variable

2019-10-29 03:23发布

我试图从GLModel排除相关的变量。 首先,我计算相关矩阵。 后来,我想落实到combn功能以某种方式排除是相关的变量(列标题)。 在这一点上我失败了 - 我无法将其集成到combn功能,使得它的工作和相关的变量被排除在外。

下面是我使用的链接数据: https://drive.google.com/open?id=0B5IgiR_svnKcZkxHeTJXTm9jUjQ

这里是我试图使它工作的代码:

## rm(list = ls())  ## Edited out to prevent accidents

mod_data <- read.csv("mod_data.csv", header = T)

mod_headers <- names(mod_data[3:ncol(mod_data)-1])

CM = which(abs(cor(mod_data[,1:ncol(mod_data)-1])-diag(1,ncol(mod_data)-1)) > 0.5, arr.ind = T)

f <- function(){

  null_model <- glm(newcol ~ 1, data=mod_data, family = binomial(link = "logit"), control = list(maxit = 50))
  best_model <- null_model
  best_aic <- AIC(null_model)

  for(i in 1:length(mod_headers)){
    tab <- combn(mod_headers,i)
    for(j in 1:ncol(tab)){
      tab_new <- c(tab[,j])
      mod_tab_new <- c(tab_new, "newcol")
      model <- glm(newcol ~., data=mod_data[c(mod_tab_new)], family = binomial(link = "logit"), control = list(maxit = 50000))
      if(AIC(model) < best_aic){
        best_model <- model
        best_aic <- AIC(model)
      }
    }
  }
  return(best_model)
}

f()

感谢您的建议!

文章来源: How to remove correlated variables from GLM in R
标签: r glm combn