我有一个data.table:
set.seed(1)
data <- data.table(time = c(1:3, 1:4),
groups = c(rep(c("b", "a"), c(3, 4))),
value = rnorm(7))
data
# groups time value
# 1: b 1 -0.6264538
# 2: b 2 0.1836433
# 3: b 3 -0.8356286
# 4: a 1 1.5952808
# 5: a 2 0.3295078
# 6: a 3 -0.8204684
# 7: a 4 0.4874291
我想计算的“价值”一栏的滞后版“群体”的每个级别内 。
结果应该像
# groups time value lag.value
# 1 a 1 1.5952808 NA
# 2 a 2 0.3295078 1.5952808
# 3 a 3 -0.8204684 0.3295078
# 4 a 4 0.4874291 -0.8204684
# 5 b 1 -0.6264538 NA
# 6 b 2 0.1836433 -0.6264538
# 7 b 3 -0.8356286 0.1836433
我曾尝试使用lag
直接:
data$lag.value <- lag(data$value)
......这显然是行不通的。
我也曾尝试:
unlist(tapply(data$value, data$groups, lag))
a1 a2 a3 a4 b1 b2 b3
NA -0.1162932 0.4420753 2.1505440 NA 0.5894583 -0.2890288
这是我想要什么差不多。 但是所产生的矢量不同于在这是有问题的data.table的顺序进行排序。
什么是最有效的方式在基础R,plyr,dplyr和data.table做到这一点?
Answer 1:
你可以内这样做data.table
library(data.table)
data[, lag.value:=c(NA, value[-.N]), by=groups]
data
# time groups value lag.value
#1: 1 a 0.02779005 NA
#2: 2 a 0.88029938 0.02779005
#3: 3 a -1.69514201 0.88029938
#4: 1 b -1.27560288 NA
#5: 2 b -0.65976434 -1.27560288
#6: 3 b -1.37804943 -0.65976434
#7: 4 b 0.12041778 -1.37804943
对于多列:
nm1 <- grep("^value", colnames(data), value=TRUE)
nm2 <- paste("lag", nm1, sep=".")
data[, (nm2):=lapply(.SD, function(x) c(NA, x[-.N])), by=groups, .SDcols=nm1]
data
# time groups value value1 value2 lag.value lag.value1
#1: 1 b -0.6264538 0.7383247 1.12493092 NA NA
#2: 2 b 0.1836433 0.5757814 -0.04493361 -0.6264538 0.7383247
#3: 3 b -0.8356286 -0.3053884 -0.01619026 0.1836433 0.5757814
#4: 1 a 1.5952808 1.5117812 0.94383621 NA NA
#5: 2 a 0.3295078 0.3898432 0.82122120 1.5952808 1.5117812
#6: 3 a -0.8204684 -0.6212406 0.59390132 0.3295078 0.3898432
#7: 4 a 0.4874291 -2.2146999 0.91897737 -0.8204684 -0.6212406
# lag.value2
#1: NA
#2: 1.12493092
#3: -0.04493361
#4: NA
#5: 0.94383621
#6: 0.82122120
#7: 0.59390132
更新
从data.table
版本> = v1.9.5
,我们可以使用shift
与type
为lag
或lead
。 默认情况下,该类型是lag
。
data[, (nm2) := shift(.SD), by=groups, .SDcols=nm1]
# time groups value value1 value2 lag.value lag.value1
#1: 1 b -0.6264538 0.7383247 1.12493092 NA NA
#2: 2 b 0.1836433 0.5757814 -0.04493361 -0.6264538 0.7383247
#3: 3 b -0.8356286 -0.3053884 -0.01619026 0.1836433 0.5757814
#4: 1 a 1.5952808 1.5117812 0.94383621 NA NA
#5: 2 a 0.3295078 0.3898432 0.82122120 1.5952808 1.5117812
#6: 3 a -0.8204684 -0.6212406 0.59390132 0.3295078 0.3898432
#7: 4 a 0.4874291 -2.2146999 0.91897737 -0.8204684 -0.6212406
# lag.value2
#1: NA
#2: 1.12493092
#3: -0.04493361
#4: NA
#5: 0.94383621
#6: 0.82122120
#7: 0.59390132
如果你需要反向,使用type=lead
nm3 <- paste("lead", nm1, sep=".")
使用原始数据集
data[, (nm3) := shift(.SD, type='lead'), by = groups, .SDcols=nm1]
# time groups value value1 value2 lead.value lead.value1
#1: 1 b -0.6264538 0.7383247 1.12493092 0.1836433 0.5757814
#2: 2 b 0.1836433 0.5757814 -0.04493361 -0.8356286 -0.3053884
#3: 3 b -0.8356286 -0.3053884 -0.01619026 NA NA
#4: 1 a 1.5952808 1.5117812 0.94383621 0.3295078 0.3898432
#5: 2 a 0.3295078 0.3898432 0.82122120 -0.8204684 -0.6212406
#6: 3 a -0.8204684 -0.6212406 0.59390132 0.4874291 -2.2146999
#7: 4 a 0.4874291 -2.2146999 0.91897737 NA NA
# lead.value2
#1: -0.04493361
#2: -0.01619026
#3: NA
#4: 0.82122120
#5: 0.59390132
#6: 0.91897737
#7: NA
数据
set.seed(1)
data <- data.table(time =c(1:3,1:4),groups = c(rep(c("b","a"),c(3,4))),
value = rnorm(7), value1=rnorm(7), value2=rnorm(7))
Answer 2:
使用包dplyr
:
library(dplyr)
data <-
data %>%
group_by(groups) %>%
mutate(lag.value = dplyr::lag(value, n = 1, default = NA))
给
> data
Source: local data table [7 x 4]
Groups: groups
time groups value lag.value
1 1 a 0.07614866 NA
2 2 a -0.02784712 0.07614866
3 3 a 1.88612245 -0.02784712
4 1 b 0.26526825 NA
5 2 b 1.23820506 0.26526825
6 3 b 0.09276648 1.23820506
7 4 b -0.09253594 0.09276648
正如@BrianD指出,这隐含地假设值是由组已经排序。 如果没有,要么按组进行排序,或者使用order_by
的说法lag
。 另外请注意,由于现有的问题与某些版本dplyr的,为了安全,参数和命名空间应该明确给出。
Answer 3:
在基础R,这将做的工作:
data$lag.value <- c(NA, data$value[-nrow(data)])
data$lag.value[which(!duplicated(data$groups))] <- NA
第一行增加滞后(1)观测的字符串。 第二串校正每个组的第一个条目,作为滞后的观察是从以前的组。
需要注意的是data
的格式data.frame
不使用data.table
。
Answer 4:
如果你想确保你避免任何问题与订货数据,你可以做到这一点,利用dplyr,喜欢的东西手动:
df <- data.frame(Names = c(rep('Dan',50),rep('Dave',100)),
Dates = c(seq(1,100,by=2),seq(1,100,by=1)),
Values = rnorm(150,0,1))
df <- df %>% group_by(Names) %>% mutate(Rank=rank(Dates),
RankDown=Rank-1)
df <- df %>% left_join(select(df,Rank,ValueDown=Values,Names),by=c('RankDown'='Rank','Names')
) %>% select(-Rank,-RankDown)
head(df)
或者可替换地,我喜欢把它在一个函数具有选定分组变量(多个),排名列(如日期或其他)的想法,以及滞后的选择数目。 这也需要lazyeval以及dplyr。
groupLag <- function(mydf,grouping,ranking,lag){
df <- mydf
groupL <- lapply(grouping,as.symbol)
names <- c('Rank','RankDown')
foos <- list(interp(~rank(var),var=as.name(ranking)),~Rank-lag)
df <- df %>% group_by_(.dots=groupL) %>% mutate_(.dots=setNames(foos,names))
selectedNames <- c('Rank','Values',grouping)
df2 <- df %>% select_(.dots=selectedNames)
colnames(df2) <- c('Rank','ValueDown',grouping)
df <- df %>% left_join(df2,by=c('RankDown'='Rank',grouping)) %>% select(-Rank,-RankDown)
return(df)
}
groupLag(df,c('Names'),c('Dates'),1)
Answer 5:
我想提一下在我的方法中的重要情况这个问题,当你不能保证每个组都有每个时间段数据的方式来补充以前的答案。 也就是说,你仍然有规律地间隔的时间序列,但有可能在这里和那里是missings。 我将重点放在两个方面来改善dplyr
解决方案。
我们先从您使用了相同的数据...
library(dplyr)
library(tidyr)
set.seed(1)
data_df = data.frame(time = c(1:3, 1:4),
groups = c(rep(c("b", "a"), c(3, 4))),
value = rnorm(7))
data_df
#> time groups value
#> 1 1 b -0.6264538
#> 2 2 b 0.1836433
#> 3 3 b -0.8356286
#> 4 1 a 1.5952808
#> 5 2 a 0.3295078
#> 6 3 a -0.8204684
#> 7 4 a 0.4874291
......但现在我们删除了几个行
data_df = data_df[-c(2, 6), ]
data_df
#> time groups value
#> 1 1 b -0.6264538
#> 3 3 b -0.8356286
#> 4 1 a 1.5952808
#> 5 2 a 0.3295078
#> 7 4 a 0.4874291
简单dplyr
解决方案不再有效
data_df %>%
arrange(groups, time) %>%
group_by(groups) %>%
mutate(lag.value = lag(value)) %>%
ungroup()
#> # A tibble: 5 x 4
#> time groups value lag.value
#> <int> <fct> <dbl> <dbl>
#> 1 1 a 1.60 NA
#> 2 2 a 0.330 1.60
#> 3 4 a 0.487 0.330
#> 4 1 b -0.626 NA
#> 5 3 b -0.836 -0.626
你看,虽然我们没有的情况下的值(group = 'a', time = '3')
上面还显示了的情况下,滞后的值(group = 'a', time = '4')
这实际上是在值time = 2
。
正确dplyr
解决方案
我们的想法是,我们添加缺少的(组,时间)的组合。 这是非常内存低效的,当你有很多可能的(组,时间)的组合,但值稀疏抓获。
dplyr_correct_df = expand.grid(
groups = sort(unique(data_df$groups)),
time = seq(from = min(data_df$time), to = max(data_df$time))
) %>%
left_join(data_df, by = c("groups", "time")) %>%
arrange(groups, time) %>%
group_by(groups) %>%
mutate(lag.value = lag(value)) %>%
ungroup()
dplyr_correct_df
#> # A tibble: 8 x 4
#> groups time value lag.value
#> <fct> <int> <dbl> <dbl>
#> 1 a 1 1.60 NA
#> 2 a 2 0.330 1.60
#> 3 a 3 NA 0.330
#> 4 a 4 0.487 NA
#> 5 b 1 -0.626 NA
#> 6 b 2 NA -0.626
#> 7 b 3 -0.836 NA
#> 8 b 4 NA -0.836
请注意,我们现在有一个在NA (group = 'a', time = '4')
这应该是预期的行为。 同样与(group = 'b', time = '3')
单调乏味的同时也使用类正确的解决方案zoo::zooreg
这个解决方案应该更好地工作,在内存方面,当案件的量是非常大的,因为不是与NA的填充缺失的情况下,它使用索引。
library(zoo)
zooreg_correct_df = data_df %>%
as_tibble() %>%
# nest the data for each group
# should work for multiple groups variables
nest(-groups, .key = "zoo_ob") %>%
mutate(zoo_ob = lapply(zoo_ob, function(d) {
# create zooreg objects from the individual data.frames created by nest
z = zoo::zooreg(
data = select(d,-time),
order.by = d$time,
frequency = 1
) %>%
# calculate lags
# we also ask for the 0'th order lag so that we keep the original value
zoo:::lag.zooreg(k = (-1):0) # note the sign convention is different
# recover df's from zooreg objects
cbind(
time = as.integer(zoo::index(z)),
zoo:::as.data.frame.zoo(z)
)
})) %>%
unnest() %>%
# format values
select(groups, time, value = value.lag0, lag.value = `value.lag-1`) %>%
arrange(groups, time) %>%
# eliminate additional periods created by lag
filter(time <= max(data_df$time))
zooreg_correct_df
#> # A tibble: 8 x 4
#> groups time value lag.value
#> <fct> <int> <dbl> <dbl>
#> 1 a 1 1.60 NA
#> 2 a 2 0.330 1.60
#> 3 a 3 NA 0.330
#> 4 a 4 0.487 NA
#> 5 b 1 -0.626 NA
#> 6 b 2 NA -0.626
#> 7 b 3 -0.836 NA
#> 8 b 4 NA -0.836
最后,让我们检查两个正确的解决方案实际上是平等的:
all.equal(dplyr_correct_df, zooreg_correct_df)
#> [1] TRUE
文章来源: How to create a lag variable within each group?