我试图使用素食包应用oecosimu。
library(sna)
library(permute)
library(lattice)
library(vegan)
library(bipartite)
bio<-read.csv("/home/vicar66/Raw_data/Jan12/98percents_April_16/otu_table/Chapter1/no_bloom_bio_data_L3.txt")
rownames(bio)<-bio[,1]
bio[,1]<-NULL
bio_m<-as.matrix(bio)
a<-oecosimu(bio_m,bipartite::C.score,"swap")
但我一直有这个错误信息:附加包:“双边”
下面对象是从“:全素包”掩蔽:
nullmodel
在rowSums误差(X):“x”的必须是至少两个维度的阵列呼叫:oecosimu - > nullmodel - > rowSums执行停止
演示数据:
Ciliophora Dinoflagellates MALVs Choanoflagellida
DNAHIN5m 0.062469804 0.826323018 0.031084701 0.000323747
DNAHIN35m 0.045216826 0.595750636 0.187010719 0.000917053
DNAHIN150m 0.018434224 0.204865296 0.531016032 0.017009618
DNAHIN240m 0.016211333 0.889640227 0.04191846 0.03087407
**第一列第一行是空的。 第一行是rownames
任何人都遇到过这个问题吗?
谢谢!