我需要在大量的.txt文件,其中的每一个包含一个十进制(一些是积极的,有些是负的)来读取,并追加到这些2门阵列(基因型和表型)。 随后,我想在SciPy的这些阵列执行一些数学运算,但是负(“ - ”)符号导致的问题。 具体来说,我不能转换阵列浮动,因为“ - ”被理解为一个字符串,引起以下错误:
ValueError: could not convert string to float:
这是因为它是目前写我的代码:
import linecache
gene_array=[]
phen_array=[]
for i in genotype:
for j in phenotype:
genotype='/path/g.txt'
phenotype='/path/p.txt'
g=linecache.getline(genotype,1)
p=linecache.getline(phenotype,1)
p=p.strip()
g=g.strip()
gene_array.append(g)
phen_array.append(p)
gene_array=map(float,gene_array)
phen_array=map(float,phen_array)
我在这一点上,它是导致问题的负号相当肯定的,但我不明白为什么。 是我使用的Linecache这里的问题? 有没有这将是更好的替代方法?
的结果
print gene_array
是
['-0.0448022516321286', '-0.0236187263814157', '-0.150505384829925', '-0.00338459268479522', '0.0142429109897682', '0.0286253352284279', '-0.0462358095345649', '0.0286232317578776', '-0.00747425206137217', '0.0231790239373428', '-0.00266935581919541', '0.00825077426011094', '0.0272744527203547', '0.0394829854063242', '0.0233109171715023', '0.165841084392078', '0.00259693465334536', '-0.0342590874424289', '0.0124600520095644', '0.0713627590092807', '-0.0189374898081401', '-0.00112750710611284', '-0.0161387333242288', '0.0227226505624106', '0.0382173405035751', '0.0455518646388402', '-0.0453048799717046', '0.0168570746329513']