我如何可以自动添加/更新因/进口/中说明:建议的版本?(How can I automaticall

2019-09-29 00:43发布

我喜欢让我的R程序包的更新,并在发展自己的包,我想坚持@哈德利的意见 :

一般情况下,它总是更好些,指定版本,并保守大约需要哪个版本。 除非你知道,否则,总是需要一个版本大于或等于您目前使用的版本。

所以,我需要一些人在这里的DESCRIPTION

Imports:
 knitr (>= 1.13),
 rmarkdown (>= 1.0)

有一个现有的工具以编程方式更新的依赖基于我公司目前已安装的软件包版本?

我知道这是一个很小的事情,我可以手动做到这一点,但我知道这是什么样的东西,很容易被遗忘。

使用包的本地安装版本作为最小的依赖性也似乎是有道理的,因为我测试/与那些依赖关系构建。

是否有一个原因,为什么我不应该这样做呢?

Answer 1:

这SHLD你问什么(当然,你仍然需要削减/输出粘贴到DESCRIPTION :-)

#' Add curent version string to package dependencies
#'
#' Will \code{cat} out a cut/paste-able set of fields for a
#' \code{DESCRIPTION} file with minimum required versions for
#' each package based upon currently available package vesions
#' in CRAN.
#'
#' @param pkg package description, can be path or package name
#' @param fields fields to get & report dependencies for
#' @note R and the R version is NOT added to \code{Depends}
#' @examples
#' add_pkg_versions("qmethod")
#' add_pkg_versions("MASS")
#' \dontrun { # assumes you're in a pkg devel dir
#' add_pkg_versions()
#' }
add_pkg_versions <- function(pkg=".",
                             fields=c("Depends", "Imports", "LinkingTo", "Suggests")) {

  require(purrr)
  walk(c("dplyr", "tools", "stringi", "devtools"), require, character.only=TRUE)

  stopifnot(is_scalar_character(pkg), pkg != "")
  fields <- match.arg(fields, c("Depends", "Imports", "LinkingTo", "Suggests"),
                      several.ok=TRUE)

  avail <- as_data_frame(available.packages())

  if (pkg == ".") {
    pkg_deps <- unclass(as_data_frame(read.dcf(file.path(package_file(), "DESCRIPTION"))))
    pkg <- pkg_deps$Package
    map(fields, ~stri_split_lines(pkg_deps[[.]])) %>%
      map(function(x) {
        if (length(x) > 0) {
          unlist(x) %>%
            stri_replace_all_regex(" \\(.*$|,", "") %>%
            discard(`%in%`, c("", "R"))
        } else { x }
      }) -> pkg_deps
    names(pkg_deps) <- fields
  } else {
    pkg_deps <- map(fields, ~flatten_chr((package_dependencies(pkg,  which=.))))
    names(pkg_deps) <- fields
  }

  pkg_deps <- discard(pkg_deps, function(x) {length(x)==0})

  map(pkg_deps, function(x) {

    non_base <- filter(avail, Package %in% x)
    base <- setdiff(x, non_base$Package)

    non_base %>%
      mutate(pv=sprintf("%s (>= %s)", Package, Version)) %>%
      select(pv) %>%
      flatten_chr() -> pkg_plus_version

    sort(c(pkg_plus_version, base))

  }) -> pkg_deps

  cat("Package: ", pkg, "\n", sep="")
  walk(names(pkg_deps), function(x) {

    cat(x, ":\n", sep="")
    sprintf("    %s", pkg_deps[[x]]) %>%
      paste0(collapse=",\n") %>%
      cat()
    cat("\n")

  })

}

你的一个包:

add_pkg_versions("qmethod")

Package: qmethod
Imports:
    digest (>= 0.6.10),
    GPArotation (>= 2014.11-1),
    knitr (>= 1.13),
    methods,
    psych (>= 1.6.6),
    tools,
    xtable (>= 1.8-2)

只是为了显示边缘情况的处理:

add_pkg_versions("MASS")

Package: MASS
Depends:
    graphics,
    grDevices,
    stats,
    utils
Imports:
    methods
Suggests:
    lattice (>= 0.20-33),
    nlme (>= 3.1-128),
    nnet (>= 7.3-12),
    survival (>= 2.39-5)


文章来源: How can I automatically add/update Depends/Imports/Suggests versions in DESCRIPTION?