我种和100×200米范围内的粗略位置的数据集。 所述数据帧的位置的部分不,我发现为可用的格式。 在这100 * 200米的矩形,也有通过名为CV一两百10×10平米。 内的每个10×10正方形有分别命名为1,2 4 5×5平米,图3和4中,(1南的2和3。西4是2东和3北)。 我想令R知道,一个是与角方在(0,0),(10,0),(0,0)和(0,10),B是以北A和有角( 0,10),(0,20),(10,10),和(10,20),并且K是在东边A和具有(10,0拐角),(10,10),(20, 0),(20,10),等等的所有10×10平米。 此外,我想令R知道每5×5米见方的是在100 * 200米的情节。
所以,我的数据帧看起来是这样的
10x10 5x5 Tree Diameter
A 1 tree1 4
B 1 tree2 4
C 4 tree3 6
D 3 tree4 2
E 3 tree5 3
F 2 tree6 7
G 1 tree7 12
H 2 tree8 1
I 2 tree9 2
J 3 tree10 8
K 4 tree11 3
L 1 tree12 7
M 2 tree13 5
最后,我希望能够绘制100×200米范围内,并让每个10×10米见方显示了树木的数量,或物种的数量,或总生物量是什么把我的数据的最佳方式成R可以使用图表和分析,或许空间数据?
这里是一个开始。
## set up a vector of all 10x10 position tags
tags10 <- c(LETTERS,
paste0("A",LETTERS),
paste0("B",LETTERS),
paste0("C",LETTERS[1:22]))
的函数来转换(例如) {"J",3}
至相应子正方形的中心。
convpos <- function(pos10,pos5) {
## convert letters to major (x,y) positions
p1 <- as.numeric(factor(pos10,levels=tags10)) ## or use match()
p1.x <- ((p1-1) %% 10) *10+5 ## %% is modulo operator
p1.y <- ((p1-1) %/% 10)*10+5 ## %/% is integer division
## sort out sub-positions
p2.x <- ifelse(pos5 <=2,2.5,7.5) ## {1,2} vs {3,4} values
p2.y <- ifelse(pos5 %%2 ==1 ,2.5,7.5) ## odd {1,3} vs even {2,4} values
c(p1.x+p2.x,p1.y+p2.y)
}
用法:
convpos("J",2)
convpos(mydata$tenbytenpos,mydata$fivebyfivepos)
重要笔记:
- 这是概念证明,我几乎可以保证我没有x的对应和y坐标完全正确。 但是,你应该能够通过这条线,由线追查,看看它在做什么?
- 它应该在载体(参见上述第二使用示例)正常工作:我从切换
switch
到ifelse
由于这个原因 - 列名(
10x10
)很可能得到错位成类似X10.10
读取数据为R时:见?data.frame
和?check.names
类似于@Ben Bolker所做的一切,这里的查找功能(尽管你可能需要转东西,使标签符合你的描述)。
tenbyten <- c(LETTERS[1:26],
paste0("A",LETTERS[1:26]),
paste0("B",LETTERS[1:26]),
paste0("C",LETTERS[1:22]))
tenbyten <- matrix(rep(tenbyten, each = 2), ncol = 10)
tenbyten <- t(apply(tenbyten, 1, function(x){rep(x, each = 2)}))
# the 1234 squares
squares <- matrix(c(rep(c(1,2),10),rep(c(4,3),10)), nrow = 20, ncol = 20)
# stick together into a reference grid
my.grid <- matrix(paste(tenbyten, squares, sep = "-"), nrow = 20, ncol = 20)
# a lookup function for the site grid
coordLookup <- function(tbt, fbf, .my.grid = my.grid){
x <- col(.my.grid) * 5 - 2.5
y <- row(.my.grid) * 5 - 2.5
marker <- .my.grid == paste(tbt, fbf, sep = "-")
list(x = x[marker], y = y[marker])
}
coordLookup("BB",2)
$x
[1] 52.5
$y
[1] 37.5
如果这是不是你要找什么,那么也许你会喜欢SpatialPolygonsDataFrame
,其中有适当的多边形ID,你附加数据等。在这种情况下,只是谷歌围绕如何使一个从无到有,并操纵row()
和col()
函数来获取你的多边形角,类似于在此查找功能,只返回给定的重心。
编辑:让SPDF开始:
这是从功能例如修改,也希望是一个良好的开端:
library(sp)
# really you have a 20x20 grid, counting the small ones.
# c(2.5,2.5) specifies the distance in any direction from the cell center
grd <- GridTopology(c(1,1), c(2.5,2.5), c(20,20)))
grd <- as.SpatialPolygons.GridTopology(grd)
# get centroids
coords <- coordinates(polys)
# make SPDF, with an extra column for your grid codes, taken from the above.
# you can add further columns to this data.frame(), using polys@data
polys <- SpatialPolygonsDataFrame(grd,
data=data.frame(x=coords[,1], y=coords[,2], my.ID = as.vector(my.grid),
row.names=getSpPPolygonsIDSlots(grd)))