我怎样才能删除除所有已安装的软件包base和recommended ？
Answer 1:
代替
已更新至R 3.0.0和必须重建所有软件包。
做就是了
update.packages(..., checkBuilt=TRUE)
这是我做我的[R 3.0.0（使用lib.loc=...指向我不同的本地目录）。 这将更新你的一切，它仍然可以从回购如CRAN 获得 。 对于install_git()等，你的运气了，需要重新安装。
但无论哪种方式，你并不需要先删除软件包。
Answer 2:
小心！ 并尝试在此之前阅读文档：
# Pasted as a commented to prevent blindly copying and pasting
# remove.packages( installed.packages( priority = "NA" )[,1] )
默认情况下，这将删除从第一个库包在你的.libPaths()
Answer 3:
如果在Linux上，最简单的办法可能是删除库文件夹，在默认情况下位于/home/yourusername/R 。
在Fedora，例如，它被称为x86_64-redhat-linux-gnu-library 。 如果该文件夹/home/yourusername/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library被删除，它会自动在河的下面开始重新创建所有默认库都经常使用。
Answer 4:
下面是在R-Blogger功能可用的解决方案：
# create a list of all installed packages
ip <- as.data.frame(installed.packages())
head(ip)
# if you use MRO, make sure that no packages in this library will be removed
ip <- subset(ip, !grepl("MRO", ip$LibPath))
# we don't want to remove base or recommended packages either\
ip <- ip[!(ip[,"Priority"] %in% c("base", "recommended")),]
# determine the library where the packages are installed
path.lib <- unique(ip$LibPath)
# create a vector with all the names of the packages you want to remove
pkgs.to.remove <- ip[,1]
head(pkgs.to.remove)
# remove the packages
sapply(pkgs.to.remove, remove.packages, lib = path.lib)
这里是链接，原帖： https://www.r-bloggers.com/how-to-remove-all-user-installed-packages-in-r/
文章来源: Remove all packages that do not come with R
