如何解读不同GGPLOT2密度？(How to interpret the different gg

我感到困惑的下列变量的含义geom_density在ggplot：

有人可以请解释这四个调用之间的区别：

1. geom_density(aes_string(x=myvar))
2. geom_density(aes_string(x=myvar, y=..density..))
3. geom_density(aes_string(x=myvar, y=..scaled..))
4. geom_density(aes_string(x=myvar, y=..count../sum(..count..)))

我的理解是：

• geom_density单独会产生密度下的曲线总和，其面积为1
• geom_density与..density..基本上不相同......？
• 在..count../sum(..count..)将归峰高更像一个标准化直方图，以确保所有的高度之和为1
• 该..count..本身没有分母只是在它的项目＃乘以每个区间
• 所述..scaled..参数将使它这样的密度的最大值为1。

我觉得..scaled..非常违反直觉的，没见过它用，如果我对它的解释是正确的，所以我想忽略。 我主要是寻找一个澄清之间的差异geom_density和一种标准化的密度图，我是这样假设需要...count../...的说法。 谢谢。

（相关： 错误与GGPLOT2映射变量y和使用STAT =“bin”的 ）

Answer 1:

为默认的审美stat_density是..density.. ，所以通话geom_density它使用stat_density默认情况下，将绘制y = ..density..默认。

你可以看到不同的列是如何通过查看计算值的源代码

..scaled..被定义为

densdf$scaled <- densdf$y / max(densdf$y, na.rm = TRUE)

随意如果你想忽略它。

综观为stat_bin源代码

结果被计算为这样的

res <- within(results, {
    count[is.na(count)] <- 0
    density <- count / width / sum(abs(count), na.rm=TRUE)
    ncount <- count / max(abs(count), na.rm=TRUE)
    ndensity <- density / max(abs(density), na.rm=TRUE)
  })

所以，如果你想比较的结果geom_histogram （使用默认stat = 'bin' ），那么你可以设置y = ..density..它将计算count / sum(count)你（占宽度垃圾箱）

如果你想比较geom_density(aes(y=..scaled..))与stat_bin ，那么你可以使用geom_histogram(aes(y = ..ndensity..))

你可以通过让他们以相同的规模..count..在这两个为好，但你会需要调整adjust参数stat_density获得曲线的适当的详细逼近。

文章来源: How to interpret the different ggplot2 densities?