I've just started with pandas some weeks ago and now I am trying to perform an element-wise division on rows, but couldn't figure out the proper way to achieve it. Here is my case and data
date type id ... 1096 1097 1098
0 2014-06-13 cal 1 ... 17.949524 16.247619 15.465079
1 2014-06-13 cow 32 ... 0.523429 -0.854286 -1.520952
2 2014-06-13 cow 47 ... 7.676000 6.521714 5.892381
3 2014-06-13 cow 107 ... 4.161714 3.048571 2.419048
4 2014-06-13 cow 137 ... 3.781143 2.557143 1.931429
5 2014-06-13 cow 255 ... 3.847273 2.509091 1.804329
6 2014-06-13 cow 609 ... 6.097714 4.837714 4.249524
7 2014-06-13 cow 721 ... 3.653143 2.358286 1.633333
8 2014-06-13 cow 817 ... 6.044571 4.934286 4.373333
9 2014-06-13 cow 837 ... 9.649714 8.511429 7.884762
10 2014-06-13 cow 980 ... 1.817143 0.536571 -0.102857
11 2014-06-13 cow 1730 ... 8.512571 7.114286 6.319048
12 2014-06-13 dark 1 ... 168.725714 167.885715 167.600001
my_data.columns
Index(['date', 'type', 'id', '188', '189', '190', '191', '192', '193', '194',
...
'1089', '1090', '1091', '1092', '1093', '1094', '1095', '1096', '1097',
'1098'],
dtype='object', length=914)
My goal is to divide all the rows by the row with "type" == "cal"
, but from the column '188'
to the column '1098'
(911 columns)
These are the approaches I have tried:
Extracting the row of interest and using it with apply(), divide() and operator '/':
>>> cal_r = my_data[my_data["type"]=="cal"].iloc[:,3:]
my_data.apply(lambda x: x.iloc[3:]/cal_r, axis=1)
0 188 189 190 191 192 193 194 195 ... 1091 10...
1 188 189 190 ... 10...
2 188 189 190 ... 109...
3 188 189 190 ... 1096...
4 188 189 190 191 ... ...
5 188 189 190 ... 10...
6 188 189 190 ... 109...
7 188 189 190 ... 1096...
8 188 189 190 ... 1096...
9 188 189 190 ... 1096 ...
10 188 189 190 ... 1...
11 188 189 190 ... 109...
12 188 189 190 191 ... ...
dtype: object
>>> mydata.apply(lambda x: x.iloc[3:].divide(cal_r,axis=1), axis=1)
Traceback (most recent call last):
File "<input>", line 1, in <module>
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/frame.py", line 6014, in apply
return op.get_result()
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/apply.py", line 142, in get_result
return self.apply_standard()
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/apply.py", line 248, in apply_standard
self.apply_series_generator()
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/apply.py", line 277, in apply_series_generator
results[i] = self.f(v)
File "<input>", line 1, in <lambda>
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/ops.py", line 1375, in flex_wrapper
self._get_axis_number(axis)
File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pandas/core/generic.py", line 375, in _get_axis_number
.format(axis, type(self)))
ValueError: ("No axis named 1 for object type <class 'pandas.core.series.Series'>", 'occurred at index 0')
Without using apply:
>>> my_data.iloc[:,3:].divide(cal_r)
188 189 190 191 192 193 ... 1093 1094 1095 1096 1097 1098
0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 ... 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0
1 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
2 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
3 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
4 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
5 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
6 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
7 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
8 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
9 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
10 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
11 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
12 NaN NaN NaN NaN NaN NaN ... NaN NaN NaN NaN NaN NaN
The commands my_data.iloc[:,3:].divide(cal_r, axis=1)
and my_data.iloc[:,3:]/cal_r
give the same result, divides just the first row.
If I select just one row, it is done well:
my_data.iloc[5,3:]/cal_r
188 189 190 ... 1096 1097 1098
0 48.8182 48.8274 22.4476 ... 0.214338 0.154428 0.116671
[1 rows x 911 columns]
Is there something basic I am missing? I suspect that I will need to replicate the cal_r
row the same number of rows of the whole data.
Any hint or guidance is really appreciated.
Related: divide pandas dataframe elements by its line max