“加权”回归中的R(“weighted” regression in R)

2019-07-29 03:02发布

我创建类似下面做一些我称为“加权”回归的脚本:

library(plyr)

set.seed(100)

temp.df <- data.frame(uid=1:200,
                      bp=sample(x=c(100:200),size=200,replace=TRUE),
                      age=sample(x=c(30:65),size=200,replace=TRUE),
                      weight=sample(c(1:10),size=200,replace=TRUE),
                      stringsAsFactors=FALSE)

temp.df.expand <- ddply(temp.df,
                        c("uid"),
                        function(df) {
                          data.frame(bp=rep(df[,"bp"],df[,"weight"]),
                                     age=rep(df[,"age"],df[,"weight"]),
                                     stringsAsFactors=FALSE)})

temp.df.lm <- lm(bp~age,data=temp.df,weights=weight)
temp.df.expand.lm <- lm(bp~age,data=temp.df.expand)

你可以看到,在temp.df ,每一行都有它的重量,我的意思是,共有1178样品是但对于同一行bpage ,他们合并成1行的代表weight列。

我用weight参数在lm功能,然后我交叉与另一个数据帧,该检查结果temp.df数据帧被“膨胀”。 但我发现lm的2数据帧不同的输出。

难道我曲解weight在参数lm功能,任何人都可以让我知道如何我运行回归正常(即没有手动扩展数据帧)的呈现就像一个数据集temp.df ? 谢谢。

Answer 1:

这里的问题是,自由度没有被正确地加起来得到正确的Df以及均值和平方的统计数据。 这将解决问题:

temp.df.lm.aov <- anova(temp.df.lm)
temp.df.lm.aov$Df[length(temp.df.lm.aov$Df)] <- 
        sum(temp.df.lm$weights)-   
        sum(temp.df.lm.aov$Df[-length(temp.df.lm.aov$Df)]  ) -1
temp.df.lm.aov$`Mean Sq` <- temp.df.lm.aov$`Sum Sq`/temp.df.lm.aov$Df
temp.df.lm.aov$`F value`[1] <- temp.df.lm.aov$`Mean Sq`[1]/
                                        temp.df.lm.aov$`Mean Sq`[2]
temp.df.lm.aov$`Pr(>F)`[1] <- pf(temp.df.lm.aov$`F value`[1], 1, 
                                      temp.df.lm.aov$Df, lower.tail=FALSE)[2]
temp.df.lm.aov
Analysis of Variance Table

Response: bp
            Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
age          1   8741  8740.5  10.628 0.001146 **
Residuals 1176 967146   822.4        

与之比较:

> anova(temp.df.expand.lm)
Analysis of Variance Table

Response: bp
            Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)   
age          1   8741  8740.5  10.628 0.001146 **
Residuals 1176 967146   822.4                    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

我有点惊讶这还没有拿出更多的时候在R-帮助。 如果不是这样,我的搜索战略发展的力量与老年减弱。



文章来源: “weighted” regression in R