As.vector不data.frame子集转换为矢量(As.vector does not con

2019-07-05 15:12发布

下面我提供的一些代码,我一直在努力的一个片段。 我在串被成功地阅读为表。 存在我的表,我想用中位数()函数的一些子集。 从什么研究,我所做的和我自己的经验值()不具有一个data.frame也不data.frame的子集定义的行为。 所以,希望适合我的问题分解成一些定义的行为,我想投我想要的子集到载体中。 然而,即使使用as.vector投我的期望子集后,我仍然有一个data.frame。 当我尝试调用这个我得到平均“的说法是不是数字或逻辑:回覆NA”

我都玩过这个颇有几分自己,并试图在这里和其他地方找到的信息。 作为一个说明我试图在这个线程accpeted解决方案中列出的方法R-友好的方式与R data.frame列转换为载体? 取得我现在有同样的结果。 我没有太在意我是如何做到这一点; 随时提出其他方法。

感谢您的时间。

for(i in 1:length(text_array)){
    temp= read.table(textConnection(text_array[i]), sep="\t",row.names=NULL, header= FALSE,  fill=TRUE) 
    value=""
    #we are now going to process temp and add it
    cur_DS=coll_data_sets[i]
    #median is the value that we are going to insert into the result array.
    #currently the logic behind it is not implemented.
    #the value will be the median of state1 divided by the median of state2.
    t_states=vector(length=ncol(temp))
    for(j in 1:ncol(temp)){
        t_states[j]=toString(temp[2,j])

    }
    t_states=(unique(t_states))
    #this logic is current is set to reject data from more than one state.
    # It will also reject anything that appears to lack state data.
    if(length(t_states) !=  2){
        value=NA
    }else{
        s1_expr=as.vector(x=(temp[3, temp[2,]==t_states[1]]))
        s2_expr=as.vector(x=temp[3, temp[2,]==t_states[2]])
        print(class(s1_expr))
    #   med1= (median(s1_expr))
    #   med2= (median(s2_expr))
    #   if(is.na(med1[1]) || is.na(med2[1])){
    #       value=-1
        }#else{
    #       value=med1[1]/med2[1]
    #       print(value)
    #   }

    }
[1] "data.frame"
[1] "data.frame"
[1] "data.frame"

下面是关于“临时”的示例值:

         V1        V2          V3          V4
1 GSM506899 GSM506900   GSM506901   GSM506902
2 wild type wild type Zbtb20 null Zbtb20 null
3      99.3     98.24        66.2      102.42
4      55.8     20.11        22.9       16.98
5     159.6     63.46       102.5       67.17
6       166     54.73         215       49.46

Answer 1:

数据帧列表。 即使你选择数据的一个单行,它仍然是一个列表。

尽量unlist 。 (假设所有的值在“行”是当然的数字的。如果不是,你有更大的问题。)



文章来源: As.vector does not convert data.frame subset to vector