热图式情节，但分类变量(heatmap-like plot, but for categorical

我有大约每50个人的三个因素（SET1，SET2和SET3）。对于SET1，SET2，并且SET3的值是 “A”， “B”， “C”。我想使这些数据的热图类情节，但具有图例示与值相关联的颜色（例如，A =“红色”，B =“蓝色”，C =“黑”）。有什么建议？

谢谢。

Answer 1:

我决定这将是easist（反正我）与GGPLOT2接近这一点：

#recreate a data set
dat <- data.frame(person=factor(paste0("id#", 1:50), 
    levels =rev(paste0("id#", 1:50))), matrix(sample(LETTERS[1:3], 150, T), ncol = 3))

library(ggplot2); library(reshape2)
dat3 <- melt(dat, id.var = 'person')
ggplot(dat3, aes(variable, person)) + geom_tile(aes(fill = value),
   colour = "white") + scale_fill_manual(values=c("red", "blue", "black"))

Answer 2:

类似的情节也可以与基础制造的图形。下面是使用碱的一种方法image的功能。该样品具有分类响应，而不是数字的。

dx <- data.frame( Tasks = c('1','2','3','4'),
                  Phase1 = c('Done','Done','Done','WIP'),
                  Phase2 = c('WIP','Done','Done',''),
                  Phase3 = c('','WIP','Done',''))

ff<-factor(as.matrix(dx[,2:4]), 
    levels=c("Done","WIP",""), 
    labels=c("done","wip","-empty-")
)
fx<-matrix(as.numeric(ff), ncol=ncol(dx)-1)

#use labels to assign colors
col<-c(done="darkgreen",wip="orange","-empty-"="black")

imgflip<-function(x) {t(x[nrow(x):1,])}

image(imgflip(fx),
    breaks=(1:(nlevels(ff)+1))-.5,
    col=col[levels(ff)],
    xaxt="n", yaxt="n"
)
axis(2, at=seq(0,1,length.out=nrow(dx)), labels=rev(paste("Task",dx$Tasks)), las=2)
axis(3, at=seq(0,1,length.out=length(names(dx))-1), labels=names(dx)[-1])

这将产生这样的画面。