提取大型矩阵的非对角切片(Extracting off-diagonal slice of larg

2019-06-26 16:47发布

我有一个大的n×n矩阵,并想借此大小不等的外斜片。 例如:

1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6

我想的R函数,给定矩阵和“角切片的宽度”时将返回只是那些值的NxN矩阵。 因此,对于以上,并说,3矩阵,我会得到:

1 x x x x x
1 2 x x x x
1 2 3 x x x
x 2 3 4 x x
x x 3 4 5 x
x x x 4 5 6

目前我使用的(原谅我)for循环是慢得令人难以置信:

getDiags<-function(ndiags, cormat){
  resmat=matrix(ncol=ncol(cormat),nrow=nrow(cormat))
  dimnames(resmat)<-dimnames(cormat)
  for(j in 1:ndiags){
    resmat[row(resmat) == col(resmat) + j] <- 
      cormat[row(cormat) == col(cormat) + j]
  }
  return(resmat)
}

我意识到,这是一个非常“非R”的方式去解决这个问题。 有没有更好的方式来做到这一点,可能使用诊断或lower.tri?

Answer 1:

size <- 6
mat <- matrix(seq_len(size ^ 2), ncol = size)


low <- 0
high <- 3

delta <- rep(seq_len(ncol(mat)), nrow(mat)) - 
    rep(seq_len(nrow(mat)), each = ncol(mat))
#or Ben Bolker's better alternative
delta <- row(mat) - col(mat)
mat[delta < low | delta > high] <- NA
mat

这部作品与我的机器上的5000 X 5000矩阵



Answer 2:

如果你想使用upper.trilower.tri你可以写这样的功能:

cormat <- mapply(rep, 1:6, 6)

u.diags <- function(X, n) {
  X[n:nrow(X),][lower.tri(X[n:nrow(X),])] <- NA
  return(X)
}

要么

l.diags <- function(X, n) {
  X[,n:ncol(X)][upper.tri(X[,n:ncol(X)])] <- NA
  return(X)
}

要么

n.diags <- function(X, n.u, n.l) {
  X[n.u:nrow(X),][lower.tri(X[n.u:nrow(X),])] <- NA
  X[,n.l:ncol(X)][upper.tri(X[,n.l:ncol(X)])] <- NA
  return(X)
}

 l.diags(cormat, 3) u.diags(cormat, 3) n.diags(cormat, 3, 1) 


Answer 3:

你可以做:

矩阵:

m<-
matrix(1:6,ncol = 6, nrow=6 ,byrow = T)

功能:

n_diag <- function (x, n) {
    d <- dim(x)
    ndiag <- .row(d) - n >= .col(d)
    x[upper.tri(x) | ndiag] <- NA
    return(x)
}

呼叫:

n_diag(m,3)

#     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
#[1,]    1   NA   NA   NA   NA   NA
#[2,]    1    2   NA   NA   NA   NA
#[3,]    1    2    3   NA   NA   NA
#[4,]   NA    2    3    4   NA   NA
#[5,]   NA   NA    3    4    5   NA
#[6,]   NA   NA   NA    4    5    6

纯娱乐:

#lapply(1:6, n_diag, x = m)


文章来源: Extracting off-diagonal slice of large matrix