[R Bioconductor的安装错误 - 行开始“<！DOCTYPE HTML PUBLI

2019-06-25 01:09发布

我在河中安装麻烦Bioconductor的包这是MacOSX上，一个新安装R 2.15的，并且使用Bioconductor的1.4.4。成绩单如下：

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
BiocInstaller version 1.4.4, ?biocLite for help
> biocLite("Biobase")
BioC_mirror: http://bioconductor.org
Using R version 2.15, BiocInstaller version 1.4.4.
Warning: unable to access index for repository http://brainarray.mbni.med.umich.edu/bioc/bin/macosx/leopard/contrib/2.15
Installing package(s) 'Biobase'
Error: Line starting '<!DOCTYPE html PUBLI ...' is malformed!
> traceback()
6: read.dcf(file = tmpf)
5: available.packages(contriburl = contriburl, method = method)
4: .install.macbinary(pkgs = pkgs, lib = lib, contriburl = contriburl, 
       method = method, available = available, destdir = destdir, 
       dependencies = dependencies, ...)
3: install.packages(pkgs = pkgs, lib = lib, repos = repos, ...)
2: biocLiteInstall(pkgs, ask = ask, siteRepos = siteRepos, suppressUpdates = suppressUpdates, 
       ...)
1: biocLite("Biobase")

我已经通过谷歌找到相关问题，建议互联网连接错误（代理等），但似乎并没有在这里如此。我可以从CRAN安装软件包就好：（即install.packages（“的foreach”））

建议将受到欢迎。

Answer 1:

我相信当我们建立这个早晨10ish西雅图的时间内完成，这是将要纠正的错误 - 在CRANextras库不再适用于Mac，和你看到一个重定向页面的顶部。寻找BiocInstaller版> 1.4.5后source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 有一个电子邮件线程的Bioconductor的邮件列表上。

文章来源: R Bioconductor installation error - Line starting '< DOCTYPE html PUBLI …' is malformed