如何使用MySQL或如何安装RMySQL包连接R'(How to Connect R wit

2019-06-23 21:30发布

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我R中新，我试图与R与MySQL连接。我已经安装mysql-5.5.22-winx64和R-2.12.0为64位。我已经设置MYSQL_HOME environment path(C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5)并试图按照下列步骤操作：

安装从这里最新RTools
安装MySQL或头和mysql的库文件
创建或编辑文件C:\Program Files\R\R-2.12.1\etc\Renviron.site并添加这样一行MYSQL_HOME=C:/mysql （路径，你的mysql文件）
副本libmysql.lib从mysql/lib到mysql/lib/opt满足的依赖关系。
复制libmysql.dll到C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin或windows/system32 directory 。

运行install.packages('RMySQL',type='source')并等待汇编将结束。但我仍收到此错误： -

 *> install.packages('RMySQL',type='source') --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- trying URL 'http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/contrib/RMySQL_0.9-3.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 165363 bytes (161 Kb) opened URL downloaded 161 Kb * installing *source* package 'RMySQL' ... ERROR: configuration failed for package 'RMySQL' * removing 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL' * restoring previous 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL' The downloaded packages are in 'C:\Users\sharad\AppData\Local\Temp\RtmpdQHwCb\downloaded_packages' Warning message: In install.packages("RMySQL", type = "source") : installation of package 'RMySQL' had non-zero exit status*

请建议我我如何才能解决这个问题？

最后，我得到了解决： -你可以看到我的详细解决方案博客。

我正在为最后2天与RMySQL包r的安装，终于得到了该解决方案，下面是安装RMySQL包的步骤： -

下载软件从下面的链接：

  * a. R2.13.2: Download R from http://cran.stat.sfu.ca/index.html b. RTools 214: Download RTools from http://cran.cict.fr c. RMySQL 0.8-0.tar.gz: Download RMySQL from http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/main/RMySQL/RMySQL_0.8-0.tar.gz d. MySQL Server 5.0: download it from http://dev.mysql.com e. RSTUDIO (optional): download it from http://rstudio.org*

设置下面的环境变量

  * a. MYSQL_HOME : <drive>/path to MySQL installation folder eg MYSQL_HOME= C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\ b. R_HOME: <drive>/path to R installation eg R_HOME=C:\Program Files\R\R-2.13.2\ c. PATH: Modify path to accommodate the above variables. *

请确保以下路径在Windows的PATH变量areincluded：\ Rtools \ 2.14 \ BIN \ Rtools \ 2.14 \ MinGW的\ BIN \ Rtools \ 2.14 \ MinGW64 \ BIN

创建文件夹和复制文件
```
  * a. OPT: Create a folder OPT under C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\lib and copy MYSQLLIB.LIB the above path. Also copy libmysql.dll to <drive>\<path>\R\R-2.14.0\bin\(64 bit) Or <Drive>\<path>\R\R-2.14.0\bin\i386\ (32 bit) and to C:\Windows\System32. b. Renviron.site: create or edit a file <DRIVE>\<path>\R\R-2.14.0\etc\Renviron.site and add a line: MYSQL_HOME =”C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/” NB: USE FORWARD SLASH AND DOUBLE QUOTES HERE c. libMySQL.dll: Copy this file to C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin\i386 as well as C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin* 
```
1. 运行命令
  一个。 Install.Packages：通过点击桌面或开始菜单将R图标运行右Gui。键入INSTALL.PACKAGES（“RMySQL”，类型=”源”）。 这将下载从仓库所需的软件。
  湾命令提示符：复制下载的zip文件（步骤4.a.中），并粘贴在R安装过程中的文件夹。进入开始菜单，打开命令提示符。进入到R安装文件夹和R型CMD INSTALL RMySQL_0.8-0.tar.gz
  *命令：
  库（RMySQL）DRV = dbDriver（ “MySQL的”）CON =数据库连接（DRV，主机= “本地主机”，则dbname = “测试”，用户= “根”，传= “根”）专辑= dbGetQuery（CON，语句= “选择t_master *”）专辑*

Answer 1:

它不是一个直接的答案，但仍可能会发现它有用：

使用更达R的最新版本（目前为2.15）
在Windows平台上，我宁愿用RODBC +的Windows MySQL驱动程序，除非你是在与在代码是大量团队成员之间共享异构平台（如Linux和Windows）环境。即使再根据其运行的平台上相同的脚本使用RMySQL和RODBC之间进行选择是一个简单的if() {...} else {...}

请注意，我不是说有没有什么你正在尝试做的成功的故事，但恕我直言，你就可以启动并运行上述越快。

Answer 2:

现在，您可以跳过所有复杂的步骤，只是做install.packages("RMySQL")

Answer 3:

我在Mac OSX上一个黑客马拉松跑进这个周末 - 我花了扎实的4小时，尽管有一些参考材料（在末尾提到）拼凑的一切。我没有找到一个简单的步行通过，所以我决定发布一个，而它在我的脑海里记忆犹新。

我不知道与Windows兼容的，但希望这些说明将会使你更容易了。

我试图让R和MySQL来在本地环境中通信（有可能需要为服务器环境的变化）。我使用的XAMPP（虽然我没有使用RMySQL的连接），但最终我还是能够使用PHP页面写一个R档，执行该文件，并有R写入到一个MySQL表。据我所知，这仅适用于MacOSX的...

使用的所有软件是DMG形式，从而没有二进制安装必要的。

下载R和运行一些基本的命令，以确保您有它的工作。
在R，您需要安装RODBC（如果你没有它的话）。输入到R控制台此。

install.packages("RODBC")

这将安装RODBC，但由于OS小牛，某些文件不再包括在内，所以你得到一个错误信息

ODBC头sql.h和sqlext.h未找到

你需要得到正确的地点sql.h和sqlext.h文件。

要做到这一点最简单的方法，确保您有自制软件安装（方便指令）。然后用这个代码在终端进行安装。

一旦这样做了，你进入到R控制台一次

install.packages("RODBC")

搜索MySQL的适当的ODBC安装。我运行的Mac OSX 10.6，所以我下载的DMG并安装它。这花了自己照顾自己。
现在到了棘手的部分。显然，苹果OX拿出ODBC管理最近OS发布后，所以你需要下载ODBC管理器（ http://www.odbcmanager.net/ ）。这也是一个DMG文件，所以只需拖放到你的实用程序文件夹。

我曾与5.3.6 DMG困难安装（固定为失败的），所以我安装5.2.7代替。

打开ODBC管理器。您需要配置的DSN，那么单击该选项卡“系统DSN”，然后单击“添加”。
你会得到一个弹出窗口，要求你选择一个驱动程序。矿井有“MySQL的ODBC驱动程序5.2”基于我的MySQL ODBC安装。单击“确定”。如果您没有看到司机，那么你需要确认所安装的MySQL的ODBC。
在接下来的弹出窗口，使任何你想要的数据源名称（DSN） - 但请记住，这是你需要使用从R.调用在下面（关键字的关键字区域将是加引号的姓名和值将是在括号中），ADD
“数据库”（与你的数据库名称的值）
“服务器”（对于本地环境上不要使用localhost - 而不是使用本地IP地址127.0.0.1 ***这对我来说是关键棋子）
“UID”（数据库用户ID）
“PWD”（数据库密码）
“插座”（不知道这是必需的，但多个教程后，留在我的配置和工作的事情，所以也许你需要它你可以在你的my.cnf插座的位置。 - 做一个Spotlight搜索的套接字文件位置是下CLIENT）
下面是我的配置看起来像：
DSN（“测试” - 这是在顶部）
数据库（“电视”）
插座（ “/Applications/XAMPP/xamppfiles/var/mysql.sock”）
UID（ “根”）
PWD（ “”）
服务器（ “127.0.0.1”）
在R，执行下面的 - 我相信这最后的3个步骤，需要每次启动R和你之前做一个MySQL查询的时间内完成。
库（RODBC）
请确保您开启的MySQL和Apache从XAMPP控制面板。
然后执行
odbcConnect（“测试”） - 注意我如何用我的DSN在双引号。交换是必要的。

这应该让你和运行。你可以阅读有关R.在制作MySQL查询其他教程

我从很多Stack Overflow上伟大的职位（感谢大家！），随机其他网站/电子邮件交流历史的黑客攻击了一起，而“R简而言之”一书由约瑟夫·阿德勒，但让我知道如果我错过了什么，或者它不清楚。

祝好运！

Answer 4:

我还花了几个小时试图让这项工作在Windows 10，收到错误。我发现RMySQL的修复是凌乱和复杂的，但RODBC有更多的无痛苦和优雅导致的解决方案。我有R，RStudio，MySQL服务器，MySQL工作台并需要以下步骤，使其工作：

安装在RStudio包install.packages(RODBC)
下载并安装MySQL ODBC连接器在这里
配置MySQL ODBC连接器。下面是一些说明。从Windows 10“ODBC”启动画面只是搜索，它会弹出窗口。获取连接参数正确，并使用测试按钮，以确保它的工作。它显示了你的数据库的一个下拉菜单，一旦连接列表。在“数据源名称”给它一个名称，其将进入将R剧本，说“mysql_odbc”

现在，您可以连接，运行查询和断开：

library(RODBC)
cursor <- odbcConnect("mysql_odbc", uid="root", pwd="HaysPuffyWalton5")
out <- sqlQuery(cursor, "SELECT * FROM emp WHERE deptno = 10");
close(cursor);

Answer 5:

这为我工作：使用Windows XP SP3 32位操作系统，R工作室，Rv2.15.3

按照说明从： http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL

但是，如果你已经下载MySQL的版本5.6，您将需要复制libmysql.lib例如存在于以下路径： D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\lib ，并创建新的文件夹，如： D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\lib\opt并粘贴上述libmysql.lib中opt文件夹。然后Renviron.site文件都会有这样的： MYSQL_HOME=D:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6 。请注意正斜杠。

最后，遵循install.packages行指令在上面提供的链接。我不得不做一些试验，以得到它的最终权利。

Answer 6:

这里遵循的指导：

http://www.ahschulz.de/2013/07/23/installing-rmysql-under-windows/

我跟着它，和它的工作就像一个魅力。 :)

Answer 7:

如果该错误中的R

library(RMySQL)
#-----------
Loading required package: DBI

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details

  call: i$Location

  error: $ operator is invalid for atomic vectors

Error: package or namespace load failed for 'RMySQL'

然后从OUTSIDE [R

set MYSQL_HOME=F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

和回场内：

library(RMySQL)

#Loading required package: DBI
#MYSQL_HOME defined as F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

以及刚从在'r

Sys.setenv(MYSQL_HOME = "F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6")
library(RMySQL)

#Loading required package: DBI
#MYSQL_HOME defined as F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

文章来源: How to Connect R with MySQL or how to install RMySQL package?